宏基因組測序服務（微生物多樣性研究）

宏基因組測序服務（微生物多樣性研究）

微生物群體幾乎存在于世界的每一個生態(tài)群落之中，且扮演著重要的的角色。傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)及鑒定方法，極大地限制了微生物多樣性資源的研究及開發(fā)利用。宏基因組測序，能夠快速準確的得到大量生物數(shù)據(jù)和豐富的微生物信息，是研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。

技術原理

2005 年，加州大學伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應用現(xiàn)代基因組學的技木直接研究自然狀態(tài)下的微生物的有機群落，而不需要在實驗室中分離單一的菌株”的科學。宏基因組測序是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象，提取環(huán)境樣本總 DNA，獲得環(huán)境微生物基因信息總和，研究環(huán)境微生物的群落結構、物種分類、基因功能及代謝網(wǎng)絡等，具有通量高、速度快、信息全等特點，在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢。

樣本類型

土壤、水體、污泥、腸道物、糞便、皮膚、食品發(fā)酵液等。

技術路線

• 樣品準備

• DNA提取

• DNA檢測

• 文庫制備

• 文庫質(zhì)檢

• 上機測序

• 生信分析

技術優(yōu)點

• 應用廣

• 通量高

• 速度快

• 數(shù)據(jù)全（不僅可以鑒定微生物群落，還可以挖掘功能基因及其代謝途徑）

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